MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 345

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017813	ATGTT	2	10	7	16	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017813	TA	3	6	26	31	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017813	ATT	2	6	53	58	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017813	AATA	2	8	201	208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017813	TTA	2	6	254	259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017813	TATT	2	8	293	300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017813	TAT	2	6	302	307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017813	T	6	6	326	331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017813	AAG	2	6	375	380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017813	TCT	2	6	391	396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017813	TTA	2	6	419	424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017813	CTT	2	6	448	453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017813	TAT	3	9	494	502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017813	TCT	2	6	505	510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017813	TCA	2	6	520	525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017813	AACC	2	8	583	590	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017813	TATT	2	8	603	610	25 %	75 %	0 %	0 %	386858962
18	NC_017813	TTA	2	6	649	654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858962
19	NC_017813	TAAA	2	8	657	664	75 %	25 %	0 %	0 %	386858962
20	NC_017813	TAA	2	6	708	713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858962
21	NC_017813	TTCT	2	8	714	721	0 %	75 %	0 %	25 %	386858962
22	NC_017813	ATAA	2	8	838	845	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017813	TC	3	6	898	903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017813	TGTA	2	8	907	914	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017813	ATA	3	9	973	981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017813	TC	3	6	1082	1087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017813	T	8	8	1091	1098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017813	TTTA	2	8	1137	1144	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017813	T	7	7	1149	1155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017813	TTTA	2	8	1163	1170	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017813	CTTT	2	8	1201	1208	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017813	T	6	6	1206	1211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017813	T	9	9	1237	1245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017813	CTA	2	6	1340	1345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017813	T	8	8	1360	1367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017813	CTT	2	6	1425	1430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017813	A	6	6	1454	1459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017813	CTT	2	6	1488	1493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017813	A	6	6	1496	1501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017813	N	1484	1484	1527	3010	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017813	T	6	6	3011	3016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017813	AT	3	6	3018	3023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017813	TAT	2	6	3033	3038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017813	ATT	3	9	3051	3059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017813	AATT	2	8	3085	3092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017813	TGA	2	6	3143	3148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858963
47	NC_017813	ATG	2	6	3181	3186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858963
48	NC_017813	AAAG	2	8	3255	3262	75 %	0 %	25 %	0 %	386858963
49	NC_017813	AAT	2	6	3264	3269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858963
50	NC_017813	AGA	2	6	3272	3277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858963
51	NC_017813	GAA	2	6	3300	3305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858963
52	NC_017813	AGT	2	6	3363	3368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017813	TTTA	2	8	3433	3440	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017813	GAAT	2	8	3507	3514	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017813	GAT	2	6	3525	3530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017813	A	7	7	3578	3584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017813	A	7	7	3588	3594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017813	TTAAA	2	10	3619	3628	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017813	TTAAA	2	10	3652	3661	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017813	TGT	2	6	3675	3680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017813	AT	4	8	3683	3690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017813	T	6	6	3754	3759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017813	AAACCA	2	12	3763	3774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017813	GTT	2	6	3778	3783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017813	GTT	2	6	3807	3812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017813	A	6	6	3817	3822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017813	N	1229	1229	3850	5078	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017813	A	7	7	5087	5093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017813	CAA	2	6	5140	5145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858964
70	NC_017813	AAAAG	2	10	5195	5204	80 %	0 %	20 %	0 %	386858964
71	NC_017813	TGA	2	6	5207	5212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858964
72	NC_017813	ACA	2	6	5220	5225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858964
73	NC_017813	AAG	2	6	5251	5256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858964
74	NC_017813	T	6	6	5342	5347	0 %	100 %	0 %	0 %	386858964
75	NC_017813	AAG	2	6	5361	5366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858964
76	NC_017813	TTG	2	6	5368	5373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858964
77	NC_017813	AATGCT	2	12	5400	5411	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386858964
78	NC_017813	GAA	2	6	5421	5426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858964
79	NC_017813	TGG	2	6	5456	5461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858964
80	NC_017813	GTG	2	6	5473	5478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858964
81	NC_017813	AGC	3	9	5486	5494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858964
82	NC_017813	GTG	2	6	5521	5526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858964
83	NC_017813	TGC	3	9	5609	5617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858964
84	NC_017813	AAGA	2	8	5619	5626	75 %	0 %	25 %	0 %	386858964
85	NC_017813	ATA	2	6	5629	5634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858964
86	NC_017813	AGG	2	6	5672	5677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858964
87	NC_017813	TGA	2	6	5726	5731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858964
88	NC_017813	ATAA	2	8	5841	5848	75 %	25 %	0 %	0 %	386858964
89	NC_017813	GA	3	6	5857	5862	50 %	0 %	50 %	0 %	386858964
90	NC_017813	TA	3	6	5920	5925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017813	ATT	2	6	5941	5946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017813	CT	3	6	5979	5984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017813	T	7	7	5984	5990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017813	T	7	7	6024	6030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017813	TGT	2	6	6036	6041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017813	TAAA	2	8	6054	6061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017813	A	6	6	6081	6086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017813	N	477	477	6089	6565	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017813	GGA	2	6	6659	6664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858965
100	NC_017813	AGA	2	6	6669	6674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858965
101	NC_017813	AGGTA	2	10	6699	6708	40 %	20 %	40 %	0 %	386858965
102	NC_017813	ATAA	2	8	6727	6734	75 %	25 %	0 %	0 %	386858965
103	NC_017813	GAA	2	6	6739	6744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858965
104	NC_017813	AGC	2	6	6756	6761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858965
105	NC_017813	TGA	2	6	6777	6782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858965
106	NC_017813	AGG	2	6	6789	6794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858965
107	NC_017813	CTA	2	6	6797	6802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858965
108	NC_017813	TGG	2	6	6807	6812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858965
109	NC_017813	CAG	2	6	6827	6832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858965
110	NC_017813	TAG	2	6	6875	6880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858965
111	NC_017813	GTG	2	6	6883	6888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858965
112	NC_017813	GA	3	6	6893	6898	50 %	0 %	50 %	0 %	386858965
113	NC_017813	ATT	2	6	6957	6962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858965
114	NC_017813	AAG	2	6	6967	6972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858965
115	NC_017813	CTG	2	6	7070	7075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858965
116	NC_017813	ATA	3	9	7076	7084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858965
117	NC_017813	GAA	2	6	7093	7098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858965
118	NC_017813	TGC	3	9	7119	7127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858965
119	NC_017813	AAGA	2	8	7129	7136	75 %	0 %	25 %	0 %	386858965
120	NC_017813	GAT	2	6	7138	7143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858965
121	NC_017813	AAGA	2	8	7144	7151	75 %	0 %	25 %	0 %	386858965
122	NC_017813	AAGG	2	8	7156	7163	50 %	0 %	50 %	0 %	386858965
123	NC_017813	AAAG	2	8	7167	7174	75 %	0 %	25 %	0 %	386858965
124	NC_017813	AGG	2	6	7188	7193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858965
125	NC_017813	AGG	2	6	7218	7223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858965
126	NC_017813	GA	3	6	7370	7375	50 %	0 %	50 %	0 %	386858965
127	NC_017813	AT	3	6	7438	7443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017813	ATTA	3	12	7468	7479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017813	CT	3	6	7496	7501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017813	T	8	8	7501	7508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017813	GTATT	2	10	7516	7525	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017813	TA	3	6	7529	7534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017813	TAA	2	6	7555	7560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017813	A	7	7	7581	7587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017813	AGG	2	6	7595	7600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017813	GAA	2	6	7602	7607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017813	AAG	2	6	7613	7618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858966
138	NC_017813	GAAG	2	8	7677	7684	50 %	0 %	50 %	0 %	386858966
139	NC_017813	GAA	2	6	7691	7696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858966
140	NC_017813	GAA	2	6	7710	7715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858966
141	NC_017813	TGG	2	6	7727	7732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858966
142	NC_017813	TGA	2	6	7733	7738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858966
143	NC_017813	GGA	2	6	7771	7776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858966
144	NC_017813	AAGAA	2	10	7781	7790	80 %	0 %	20 %	0 %	386858966
145	NC_017813	GCTACT	2	12	7804	7815	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017813	AGATA	2	10	7845	7854	60 %	20 %	20 %	0 %	386858967
147	NC_017813	TGG	2	6	7857	7862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858967
148	NC_017813	TGC	2	6	7917	7922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858967
149	NC_017813	TGG	2	6	7932	7937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858967
150	NC_017813	GTA	2	6	7963	7968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858967
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152	NC_017813	TTGT	2	8	8092	8099	0 %	75 %	25 %	0 %	386858967
153	NC_017813	TGC	2	6	8109	8114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858967
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160	NC_017813	AAT	4	12	8242	8253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858967
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167	NC_017813	TAAA	2	8	8550	8557	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017813	ATT	2	6	8558	8563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_017813	T	7	7	8723	8729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_017813	AAC	2	6	8730	8735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_017813	TAA	2	6	8743	8748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017813	AGT	2	6	8768	8773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
174	NC_017813	GAT	2	6	8787	8792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_017813	TTTA	2	8	8866	8873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_017813	T	7	7	8922	8928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_017813	A	7	7	8965	8971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_017813	AGG	2	6	8974	8979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
182	NC_017813	A	7	7	8982	8988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_017813	AAAG	2	8	9002	9009	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
184	NC_017813	ATT	2	6	9017	9022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_017813	CT	3	6	11535	11540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
265	NC_017813	TTAT	2	8	11541	11548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_017813	TA	3	6	11567	11572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_017813	ATTT	2	8	11580	11587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_017813	T	6	6	11589	11594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_017813	AGAA	2	8	11626	11633	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
270	NC_017813	A	6	6	11632	11637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_017813	AATG	2	8	11653	11660	50 %	25 %	25 %	0 %	386858970
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282	NC_017813	AG	3	6	11809	11814	50 %	0 %	50 %	0 %	386858970
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284	NC_017813	TGG	2	6	11892	11897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858970
285	NC_017813	AAG	2	6	11954	11959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858970
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.